MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 plasmid pUSDA257

Total Repeats: 59

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018193	CAG	2	6	1078	1083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_018193	CGA	2	6	1098	1103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_018193	A	6	6	1202	1207	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018193	TGC	2	6	1322	1327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_018193	CAA	2	6	1389	1394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_018193	AGG	2	6	1424	1429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018193	CCG	2	6	1456	1461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_018193	CCG	2	6	1471	1476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_018193	GAG	2	6	1493	1498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018193	CAG	2	6	1545	1550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_018193	GCG	2	6	1577	1582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_018193	GATG	2	8	1625	1632	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018193	GAA	2	6	1676	1681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018193	AGC	2	6	1723	1728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_018193	TCG	2	6	1755	1760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_018193	TTGC	2	8	2598	2605	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_018193	CG	3	6	2640	2645	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_018193	CTC	2	6	2720	2725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_018193	GC	3	6	2764	2769	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_018193	CCG	2	6	2772	2777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_018193	CAT	2	6	2796	2801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_018193	CT	3	6	2984	2989	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_018193	ATTT	2	8	3047	3054	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018193	TGC	2	6	3070	3075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_018193	AAAG	2	8	3151	3158	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018193	CAT	2	6	3175	3180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_018193	GGT	2	6	3216	3221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018193	GCG	2	6	3325	3330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_018193	CTT	2	6	3889	3894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_018193	TGA	2	6	3954	3959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018193	GAG	2	6	3965	3970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018193	GGC	2	6	4049	4054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_018193	GCC	2	6	4128	4133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_018193	GC	3	6	5486	5491	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_018193	TCCTGC	2	12	5562	5573	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
36	NC_018193	GAT	2	6	5610	5615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018193	GGA	2	6	5676	5681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018193	ATGG	2	8	5698	5705	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018193	GTC	2	6	5980	5985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_018193	CGC	2	6	6054	6059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_018193	GGT	2	6	6115	6120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018193	AGG	2	6	6176	6181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018193	TTG	2	6	6182	6187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018193	GCT	2	6	8934	8939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_018193	ACC	2	6	8954	8959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_018193	CGG	2	6	8969	8974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_018193	GAA	2	6	9034	9039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018193	ACG	2	6	9058	9063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_018193	GCG	2	6	9879	9884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_018193	TTCGTC	2	12	9908	9919	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_018193	TCG	2	6	9926	9931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_018193	CGATG	2	10	9954	9963	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_018193	GCG	2	6	10225	10230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_018193	ATCG	2	8	10260	10267	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_018193	GCC	3	9	10297	10305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_018193	CG	3	6	10322	10327	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_018193	CAC	2	6	10334	10339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_018193	GGCC	2	8	10382	10389	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_018193	ATC	2	6	11302	11307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.